javascript を使った web サイト

javascript を使った web サイトって結構多いですが,「どうやって作っているんだろう?コンピュータが出力しているようなコードだしなあ。」と疑問に思っていたところ,GWT のようなものがあるのですね。java で書いたプログラムをjavascript に変換するものなんでしょうか。無知なことに知りませんでした。。。

python な私は,py2exe から想像するに py2js 的なものがあるに違いないと思って検索したら,やはりありました。
http://www.mccarroll.net/py2js/index.html

もう少し調べたところ,
http://pyjs.org/
もありました。こっちのほうが,更新も最近だし,良さそうでしょうか。時間があれば,いじってみたいと思ってます。

だけど,サーバサイドのプログラムはどうやって作るんでしょうね?セキュリティなんかも典型的なものには対処できているのでしょうかね?